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| DC Field | Value | Language |
|---|---|---|
| dc.contributor.advisor | Soon Sun Kim | - |
| dc.contributor.author | 원지향 | - |
| dc.date.issued | 2024-08 | - |
| dc.identifier.other | 33876 | - |
| dc.identifier.uri | https://aurora.ajou.ac.kr/handle/2018.oak/39199 | - |
| dc.description | 학위논문(석사)--의생명과학과,2024. 8 | - |
| dc.description.abstract | Hepatocellular carcinoma (HCC) is one of the cancers with the highest mortality rates, underlining the criticality of early diagnosis improved prognosis; however, the current diagnostic markers often lack the required sensitivity. Therefore, identification of novel biomarkers for early detection is essential. Recent studies have reported a correlation between HCC and the aberrant expression of long noncoding RNAs. This study delved into the potential of long intergenic nonprotein-coding RNA 01446 (LINC01446) as a liquid biopsy marker, while exploring its functional role in HCC. Analysis of RNA-seq data from a human multistage hepatocarcinogenesis dataset revealed LINC01446 as a novel lncRNA associated with HCC. To evaluate the diagnostic performance of small extracellular vesicle LINC01446 (EV-LINC01446), internal, external, and multi-center cohorts were established. In all cohorts, quantitative real time-polymerase chain reaction analysis demonstrated that the area under the curve value for small EV-LINC01446 was higher than that for alpha-fetoprotein. Additionally, in vitro and in vivo experiments were performed to investigate the role of LINC01446 in HCC. The results indicated that LINC01446 did not affect cell growth and proliferation, but played a significant role in promoting HCC metastasis. In conclusion, this study suggests LINC01446 has potential as a liquid biopsy diagnostic marker and a therapeutic target in HCC.|간세포암종은 높은 사망률을 가진 암 중 하나로, 좋은 예후를 기대하기 위해서는 조기 진단이 매우 중요하다. 하지만 기존의 진단 마커는 민감도가 낮기 때문에, 조기 발견을 위한 새로운 진단 바이오마커의 식별이 필요하다. 최근 여러 연구에서 간세포암종과 긴 비암호화 RNA (lncRNA)의 비정상적인 발현에 상관관계가 있다고 보고하였다. 우리는 간세포암종에서 긴 비암호화 RNA 중 하나인 LINC01446의 액체 생검 진단마커로써의 가능성과 기능을 평가하였다._x000D_ <br>단계별 간암 발생 데이터셋의 RNA-seq 데이터를 분석한 결과, LINC01446가 간세포암종에서 유망한 긴 비암호화 RNA로 식별되었다. LINC01446의 간세포암종 진단 성능을 평가하기 위해 내부 코호트와 외부 코호트, 그리고 다기관 코호트를 확립하였고, 모든 코호트에서 작은 세포밖 소포체 유래 LINC01446의 진단력이 혈청 알파태아단백보다 우수한 것을 qRT-PCR 분석을 통해 확인하였다. 간세포암종에서 LINC01446의 기능을 조사하기 위해 세포실험 및 동물 실험을 수행했고, LINC01446이 간세포암종 세포 성장 및 증식에는 영향을 미치지 않지만, 전이를 촉진하는 역할을 한다는 것을 확인하였다. 결론적으로, 이번 연구에서는 LINC01446의 액체 생검 기반 간세포암종 진단 마커로서의 잠재력과 간세포암종 전이 억제 치료 표적으로서의 가능성을 제시한다. | - |
| dc.description.tableofcontents | Ⅰ. INTRODUCTION. 1_x000D_ <br>Ⅱ. MATERIALS AND METHODS. 3_x000D_ <br> 1. Public dataset resources. 3_x000D_ <br> 2. Patient sample collection and clinical terminology definitions. 3_x000D_ <br> 3. Cell culture and transfection. 8_x000D_ <br> 4. Isolation of RNA from pairs of HCC tissues and cell lines. 9_x000D_ <br> 5. Prediction of LINC01446 derived in EVs. 10_x000D_ <br> 6. Separation of blood samples. 10_x000D_ <br> 7. Isolation of RNA from blood. 10_x000D_ <br> 8. Identification of small EVs. 11_x000D_ <br> 9. Quantitative real time-polymerase chain reaction (qRT-PCR). 11_x000D_ <br> 10. Western blotting. 12_x000D_ <br> 11. Immunofluorescence. 14_x000D_ <br> 12. Inhibition of endocytosis. 14_x000D_ <br> 13. Cell growth and viability. 14_x000D_ <br> 14. Wound healing assay. 15_x000D_ <br> 15. Transwell assay. 15_x000D_ <br> 16. Mouse models. 16_x000D_ <br> 17. Immunohistochemistry. 18_x000D_ <br> 18. Statistical analysis. 18_x000D_ <br>Ⅲ. RESULTS. 20_x000D_ <br> 1. Identify HCC-associated lncRNA and analysis of their clinical correlation. 20_x000D_ <br> 2. LINC01446 as a non-invasive diagnosis marker for HCC. 24_x000D_ <br> 3. LINC01446 knockdown inhibits in vitro metastasis of HCC. 30_x000D_ <br> 4. LINC01446 knockdown suppresses in vivo metastasis of HCC. 34_x000D_ <br>Ⅳ. DISCUSSION. 38_x000D_ <br>Ⅴ. REFERENCES. 40_x000D_ <br>국문요약. 43_x000D_ | - |
| dc.language.iso | eng | - |
| dc.publisher | The Graduate School, Ajou University | - |
| dc.rights | 아주대학교 논문은 저작권에 의해 보호받습니다. | - |
| dc.title | Functional insights into LINC01446 and its implications for hepatocellular carcinoma diagnosis and metastasis | - |
| dc.type | Thesis | - |
| dc.contributor.affiliation | 아주대학교 대학원 | - |
| dc.contributor.department | 일반대학원 의생명과학과 | - |
| dc.date.awarded | 2024-08 | - |
| dc.description.degree | Master | - |
| dc.identifier.url | https://dcoll.ajou.ac.kr/dcollection/common/orgView/000000033876 | - |
| dc.subject.keyword | biomarker | - |
| dc.subject.keyword | hepatocellular carcinoma | - |
| dc.subject.keyword | liquid biopsy | - |
| dc.subject.keyword | lncRNA | - |
| dc.description.alternativeAbstract | 간세포암종은 높은 사망률을 가진 암 중 하나로, 좋은 예후를 기대하기 위해서는 조기 진단이 매우 중요하다. 하지만 기존의 진단 마커는 민감도가 낮기 때문에, 조기 발견을 위한 새로운 진단 바이오마커의 식별이 필요하다. 최근 여러 연구에서 간세포암종과 긴 비암호화 RNA (lncRNA)의 비정상적인 발현에 상관관계가 있다고 보고하였다. 우리는 간세포암종에서 긴 비암호화 RNA 중 하나인 LINC01446의 액체 생검 진단마커로써의 가능성과 기능을 평가하였다._x000D_ <br>단계별 간암 발생 데이터셋의 RNA-seq 데이터를 분석한 결과, LINC01446가 간세포암종에서 유망한 긴 비암호화 RNA로 식별되었다. LINC01446의 간세포암종 진단 성능을 평가하기 위해 내부 코호트와 외부 코호트, 그리고 다기관 코호트를 확립하였고, 모든 코호트에서 작은 세포밖 소포체 유래 LINC01446의 진단력이 혈청 알파태아단백보다 우수한 것을 qRT-PCR 분석을 통해 확인하였다. 간세포암종에서 LINC01446의 기능을 조사하기 위해 세포실험 및 동물 실험을 수행했고, LINC01446이 간세포암종 세포 성장 및 증식에는 영향을 미치지 않지만, 전이를 촉진하는 역할을 한다는 것을 확인하였다. 결론적으로, 이번 연구에서는 LINC01446의 액체 생검 기반 간세포암종 진단 마커로서의 잠재력과 간세포암종 전이 억제 치료 표적으로서의 가능성을 제시한다. | - |
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